189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3607 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  93.84 
 
 
211 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  93.84 
 
 
211 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  93.84 
 
 
211 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  93.36 
 
 
211 aa  410  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  93.36 
 
 
211 aa  410  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  93.84 
 
 
211 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  93.36 
 
 
211 aa  410  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  93.84 
 
 
211 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  91.47 
 
 
211 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  79.15 
 
 
209 aa  351  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  77.73 
 
 
209 aa  347  7e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  77.51 
 
 
207 aa  343  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  77.51 
 
 
207 aa  343  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  77.51 
 
 
207 aa  343  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  77.62 
 
 
209 aa  339  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  74.88 
 
 
217 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  71.56 
 
 
211 aa  320  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0508  toluene tolerance protein Ttg2  39.81 
 
 
213 aa  174  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002412  uncharacterized ABC transporter auxiliary component YrbC  38.03 
 
 
212 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2099  hypothetical protein  41.12 
 
 
213 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  40.2 
 
 
223 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  36.89 
 
 
208 aa  159  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  37.02 
 
 
213 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  38.68 
 
 
221 aa  158  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4533  toluene tolerance family protein  38.83 
 
 
257 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  35.08 
 
 
217 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  37.04 
 
 
220 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  36.57 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  37.04 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  38.21 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  38.21 
 
 
217 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  38.21 
 
 
217 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  38.21 
 
 
217 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  37.32 
 
 
220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03655  hypothetical protein  39.36 
 
 
212 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  36.11 
 
 
220 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  36.41 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  36.63 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  36.45 
 
 
220 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  37.14 
 
 
222 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  36.6 
 
 
204 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  34.67 
 
 
217 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  34.25 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  30.73 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  31.16 
 
 
210 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  31.16 
 
 
210 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  31.16 
 
 
210 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  31.07 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  30.65 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  30.65 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  30.65 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  28.57 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  24.57 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  28.43 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  23.15 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  25.96 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  29.08 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  26.84 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  26.84 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  25.63 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  25.63 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  24.29 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  25.58 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  26.09 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  25.25 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  27.23 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  27.23 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  27.62 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  26.76 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  26.76 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  26.76 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  26.29 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  26.63 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  26.29 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4019  toluene tolerance family protein  28.81 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163851  normal  0.13623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  28.09 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  25.24 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  25.65 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  25.84 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  28.18 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  27.64 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  26.67 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  28.3 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  28.5 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  28.1 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  26.73 
 
 
219 aa  72  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  25.24 
 
 
213 aa  72  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  27.55 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  26.15 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  26.7 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  24.21 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  27.67 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  26.6 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  29.41 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>