184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0813 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  77 
 
 		 200 aa  325  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  64 
 
 		 202 aa  278  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  65.28 
 
 		 198 aa  255  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  57.36 
 
 		 199 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  37.06 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  36.63 
 
 		 212 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  31.28 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  35.82 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  32.28 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  34.74 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  33.7 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  27.62 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  29.17 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  31.82 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3118  toluene tolerance family protein  32.93 
 
 		 175 aa  91.3  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00282764  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  26.46 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  26.46 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  26.49 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  29.08 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  29.9 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  25.81 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0404  toluene tolerance family protein  30.1 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  27.98 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  29.56 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  30.5 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  27.72 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  29.89 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  27.88 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  30.5 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  25.39 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  27.7 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  29.95 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  33.33 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  29.88 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  26.37 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  29.69 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1564  toluene tolerance protein, putative  25.4 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.831051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  32.76 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  26.14 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  26.14 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0278  putative toluene tolerance protein  24.87 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  29.89 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1375  toluene tolerance protein, putative  24.87 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  28.97 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  29.06 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  30.41 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  25.85 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1280  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  25.77 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  26.87 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  24.14 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  26.37 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  25.7 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  24.14 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  25.7 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  24.14 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  24.14 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  24.14 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  27.6 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  24.14 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  29.79 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  26.15 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  28.5 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  25.74 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  31.5 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  33.33 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  27.32 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  33.59 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  27.41 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  25.74 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  24.48 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  28.57 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  30.58 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  25.74 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  25.74 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  25.74 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  25.74 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  24.75 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  24.48 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  27.03 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  27.22 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0365  toluene tolerance protein Ttg2D  22.92 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  25.53 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  24.75 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  23.67 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  30.77 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  27.32 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.89 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  31.54 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2201  toluene tolerance protein Ttg2D  24.73 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  25 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  26.73 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  22.56 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1282  toluene tolerance  25.45 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  24.41 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  26.15 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  25.13 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  22 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0320  toluene tolerance protein Ttg2D  23.44 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.650296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>