156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2398 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  100 
 
 		 220 aa  450  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1331  toluene tolerance family protein  32.94 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1575  toluene tolerance family protein  31 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  29.81 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  30.2 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  29.33 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  26.18 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0221  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  26.74 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  27.59 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  30.3 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  28.71 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  28.37 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  26.87 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  32.54 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  29.09 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1155  toluene tolerance family protein  28.4 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  24.48 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  25.4 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  25.4 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  27.27 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  30.23 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  24.62 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  28.04 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  27.22 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  28.18 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  25.93 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  25.54 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  25 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  26.76 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  26 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  27.64 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  27.37 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  22.84 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  25.24 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  27.32 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  22.84 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  22.84 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  23.84 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  27.32 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  26.4 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  22.34 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  22.34 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  22.34 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  25.95 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  23.76 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.1 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  20.42 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  23.26 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  25.59 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1280  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  26.88 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  23.08 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  26.11 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0442  toluene tolerance family protein  24.42 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  24.82 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  24.71 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  24.81 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  24.88 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  29.27 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  22.51 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  24.02 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  24.02 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  24.46 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  27.44 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  25.52 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  28.46 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  18.68 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  29.73 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  23.63 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  23.5 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  28.83 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  28.83 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  23.04 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  26.9 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  23.71 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2481  toluene tolerance  23.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.996005  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  23.68 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  23.68 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  23.68 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0320  toluene tolerance protein Ttg2D  20.96 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.650296  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  23.68 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  24.62 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4444  toluene tolerance protein, putative  26.19 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  23.44 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  24.03 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2034  toluene tolerance family protein  22.14 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.601085  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  24.68 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  20.1 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0117  toluene tolerance family protein  23.15 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.268092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  22.5 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  27.93 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  27.93 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  27.93 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  27.93 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  20.98 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  24.21 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  23.96 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  27.93 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  20.1 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  26.72 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0182725 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>