60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0442 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0442  toluene tolerance family protein  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  26.87 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0221  toluene tolerance family protein  28.05 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  31.67 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  25.67 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1575  toluene tolerance family protein  26.53 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  26.72 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1155  toluene tolerance family protein  28.02 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  23.42 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  31.93 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  32.17 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  27.5 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  22.4 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  27.62 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  32.77 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1331  toluene tolerance family protein  25.73 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  32.77 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  30.77 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  22.22 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  22.22 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  22.22 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  22.22 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  22.22 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  18.89 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  18.89 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  19.78 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  25.98 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  20.29 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  25.73 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  26.89 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2034  toluene tolerance family protein  21.23 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.601085  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  20.73 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  22.56 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  21.5 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  24.59 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  21.62 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  21.32 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  21.32 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  21.32 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  21.32 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  24.74 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  21.32 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  21.32 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  29.57 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  20.2 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  20.21 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  20.69 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  21.32 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  21.32 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  22.4 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  28.57 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  26.72 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  29.06 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  20 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  26.5 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  24.8 
 
 		 218 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  25.16 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  24.8 
 
 		 218 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  24.12 
 
 		 209 aa  41.2  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  24.73 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>