70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1155 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1155  toluene tolerance family protein  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0221  toluene tolerance family protein  45.08 
 
 
208 aa  158  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1575  toluene tolerance family protein  31.53 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1331  toluene tolerance family protein  29.76 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258778  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  28.99 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  29.57 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  26.83 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  30.67 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0117  toluene tolerance family protein  27.08 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.268092  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0442  toluene tolerance family protein  27.08 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174385  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  25.82 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  29.41 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0890  hypothetical protein  24.57 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2549  toluene tolerance family protein  24.57 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642683  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  29.91 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  25.93 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2034  toluene tolerance family protein  24.24 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.601085  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  24.48 
 
 
203 aa  55.1  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  29.2 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  29.74 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  25.33 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  27.59 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  25.16 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  25.16 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  29.41 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  27.94 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  29.41 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  29.41 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  27.94 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  29.41 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  27.94 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  27.94 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  29.41 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  29.41 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  28.21 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  27.94 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  27.94 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  27.94 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  27.94 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  28.22 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  25.49 
 
 
218 aa  51.6  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  26.67 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  27.74 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  28.68 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  27.61 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  24.26 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  24.26 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  21.13 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  26.02 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  24.26 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  24.31 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  22.92 
 
 
217 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2481  toluene tolerance  25.63 
 
 
196 aa  48.5  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.996005  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  24.74 
 
 
213 aa  48.5  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  26.67 
 
 
204 aa  48.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  25.65 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  25.65 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  20.9 
 
 
208 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  27.34 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0365  toluene tolerance protein Ttg2D  22.45 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  22.95 
 
 
219 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  22.95 
 
 
219 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1834  toluene tolerance family protein  23.87 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  24.56 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  22.29 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  24.58 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  26.28 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  21.47 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  28.57 
 
 
222 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  23.74 
 
 
203 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>