165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1746 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  100 
 
 
208 aa  428  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  46.75 
 
 
227 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  38.25 
 
 
216 aa  154  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  35.48 
 
 
219 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  35.48 
 
 
219 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0056  toluene tolerance  33.71 
 
 
212 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.171728  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1834  toluene tolerance family protein  32.14 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  23.32 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  27.23 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  28.18 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  28.5 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  28.5 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  27.66 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  28.5 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  28.5 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  28.5 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7152  toluene tolerance family protein  29.02 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0508  toluene tolerance protein Ttg2  26.9 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6337  toluene tolerance family protein  29.03 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267397 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  28.37 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  28.04 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  28.04 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  28.04 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  28.04 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  28.04 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  28.04 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  28.04 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  28.04 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  24.86 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  24.86 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  26.7 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  25.77 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  24.86 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0975  toluene tolerance family protein  27.68 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475076  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  27.46 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  25.89 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  24.76 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  23.88 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  30.53 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  26.74 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  26.5 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  23.76 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  29.58 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  24.63 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  25.94 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3453  toluene tolerance family protein  31.49 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal  0.12161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  23.16 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  25.94 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  23.32 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  23.16 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3762  toluene tolerance family protein  31.49 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.990585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  25.94 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1282  toluene tolerance  23.4 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  28.47 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  25.12 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  24.87 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  21 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  27.67 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  25 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  26.72 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  26.76 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  23.84 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1290  hypothetical protein  24.68 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  24.63 
 
 
209 aa  58.9  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2201  toluene tolerance protein Ttg2D  24.48 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  26.32 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  24.59 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  23.03 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  23.16 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  26.37 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  23.94 
 
 
217 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  27.66 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3651  toluene tolerance family protein  30.34 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0501404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  27.52 
 
 
252 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  23.4 
 
 
217 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  26.14 
 
 
217 aa  54.7  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  23.63 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  25 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  23.21 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  23.24 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  22.33 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  23.92 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  25 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  23.74 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  24.48 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  22.87 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  24.48 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  26.06 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  21.39 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  23.68 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0404  toluene tolerance family protein  23.24 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  24.24 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  26.6 
 
 
201 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4533  toluene tolerance family protein  27.46 
 
 
257 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  26.21 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  24.76 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  23.46 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  20.71 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  22.78 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  24.32 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>