67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3762 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3453  toluene tolerance family protein  99.52 
 
 
207 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal  0.12161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3762  toluene tolerance family protein  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.990585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3651  toluene tolerance family protein  90.82 
 
 
206 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0501404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0975  toluene tolerance family protein  58.45 
 
 
207 aa  224  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475076  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7152  toluene tolerance family protein  48.51 
 
 
229 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6337  toluene tolerance family protein  48.42 
 
 
224 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  32.79 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  31.22 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  29.86 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  31.5 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  29.9 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  33.56 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  34.67 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1834  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  30.58 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1290  hypothetical protein  23.35 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  30.32 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  31.28 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  30.1 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  35.14 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  31.5 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0056  toluene tolerance  31.21 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.171728  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  34.01 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  27.8 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  28.49 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  29.14 
 
 
211 aa  58.2  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  28.43 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  26.44 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  28.65 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  27.74 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  23.5 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  25.64 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  27.43 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  30.2 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  28.87 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  27.19 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  28.97 
 
 
213 aa  51.6  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  25 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  24.2 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  27.78 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  23.72 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  25.56 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  26.85 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  24.52 
 
 
208 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  23.72 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  27.1 
 
 
213 aa  48.9  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  23.72 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  23.72 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  27.42 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  23.08 
 
 
210 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  23.08 
 
 
210 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  23.08 
 
 
210 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  25.33 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  30.16 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  28.47 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  24.68 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  25.33 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0069  hypothetical protein  21.95 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  27.23 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  26.95 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  26.67 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  26.67 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  26 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  26.67 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  25.16 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  26.49 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  25 
 
 
224 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>