79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6337 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6337  toluene tolerance family protein  100 
 
 
224 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7152  toluene tolerance family protein  77.83 
 
 
229 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3453  toluene tolerance family protein  48.62 
 
 
207 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal  0.12161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3762  toluene tolerance family protein  48.62 
 
 
207 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.990585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3651  toluene tolerance family protein  46.96 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0501404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0975  toluene tolerance family protein  48.37 
 
 
207 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475076  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1834  toluene tolerance family protein  31.07 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  28.57 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  28.89 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  26 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  31.01 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  25.81 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  26.97 
 
 
220 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  29.45 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.45 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  25.5 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0056  toluene tolerance  27.23 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.171728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  25.99 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  24.04 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  27.03 
 
 
190 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  26.7 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  26.56 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  28.48 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  22.84 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  26.49 
 
 
219 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  26.49 
 
 
219 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  25.83 
 
 
213 aa  52.4  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  29.14 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  29.14 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  29.14 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  25.29 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  31.58 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  24.26 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  25.17 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  28.48 
 
 
216 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  26.14 
 
 
211 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  32.03 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  26.92 
 
 
209 aa  48.5  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  25.97 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  32.24 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  28.48 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  22.84 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  25.57 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  24.6 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  22.55 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  23.95 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  25.69 
 
 
212 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  25.97 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  23.7 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  31.58 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  31.58 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  25.84 
 
 
215 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2367  hypothetical protein  31.58 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  31.58 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  31.58 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  31.58 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  24.43 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  31.58 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  24.73 
 
 
210 aa  45.1  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  31.25 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  24.6 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  23.86 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  22.73 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  22.41 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  25 
 
 
217 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  26.43 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  24.32 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  27.64 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  27.64 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  27.64 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  24.07 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  24.07 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  24.07 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  21.47 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  25 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  23.35 
 
 
212 aa  42  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  26.98 
 
 
214 aa  41.6  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0069  hypothetical protein  17.65 
 
 
209 aa  41.6  0.01  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  25.19 
 
 
211 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>