108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0975 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0975  toluene tolerance family protein  100 
 
 
207 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475076  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3453  toluene tolerance family protein  56.52 
 
 
207 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal  0.12161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3762  toluene tolerance family protein  56.04 
 
 
207 aa  225  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.990585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3651  toluene tolerance family protein  56.04 
 
 
206 aa  221  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0501404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7152  toluene tolerance family protein  47.12 
 
 
229 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6337  toluene tolerance family protein  47.85 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1290  hypothetical protein  27.71 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0056  toluene tolerance  27.72 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.171728  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  31 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  28.93 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  31.31 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  22.44 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1834  toluene tolerance family protein  26.95 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  28.24 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  25.73 
 
 
210 aa  61.6  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  28.12 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  34.11 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  32.81 
 
 
252 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  25.63 
 
 
224 aa  58.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  30.3 
 
 
220 aa  58.2  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  31.82 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  28.78 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  29.07 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  31.82 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  31.82 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  31.82 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  26.6 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  29.69 
 
 
198 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  25.13 
 
 
211 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  31.58 
 
 
198 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  27.86 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  28.03 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  27.33 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  26.03 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  36.36 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  27.32 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  29.69 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  29.69 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  29.69 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  29.69 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  29.69 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  29.69 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2367  hypothetical protein  29.69 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  25 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  33.33 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  33.62 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  26.81 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  26.57 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  27.54 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  27.54 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  27.54 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  31.43 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  22.5 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  27.81 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  27.78 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  26.81 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  26.25 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  26.81 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  26.81 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  24.84 
 
 
199 aa  48.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  26.62 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  27.03 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  27.7 
 
 
209 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  27.01 
 
 
210 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  23.87 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  26.62 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0069  hypothetical protein  18.29 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2201  toluene tolerance protein Ttg2D  24.6 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  26.98 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  26.98 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  26.98 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  26.98 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  26.98 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  29.32 
 
 
190 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0937  hypothetical protein  18.78 
 
 
202 aa  45.4  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  27.42 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  26.98 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  26.98 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  26.98 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  22.92 
 
 
198 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  25.93 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  20.89 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  23.56 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  25.53 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  26.53 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  26.53 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  26.53 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  26.15 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  26.4 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  25.56 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  26.98 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  26.98 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  26.98 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  26.98 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  26.98 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  26.98 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  28.97 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  25.98 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  23.08 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>