187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3731 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  99.52 
 
 
210 aa  423  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  99.52 
 
 
210 aa  423  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  99.52 
 
 
210 aa  423  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  97.14 
 
 
210 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  88.57 
 
 
210 aa  362  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  88.1 
 
 
210 aa  362  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  87.14 
 
 
214 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  87.14 
 
 
214 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  87.14 
 
 
210 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  86.67 
 
 
210 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  86.19 
 
 
210 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  70.48 
 
 
209 aa  310  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  70.14 
 
 
211 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  70.14 
 
 
210 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  68.14 
 
 
214 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  61.41 
 
 
223 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  49.76 
 
 
213 aa  207  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  50 
 
 
210 aa  205  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  47.12 
 
 
208 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  48.7 
 
 
209 aa  203  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  47.6 
 
 
211 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  50 
 
 
211 aa  194  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  48.33 
 
 
211 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  47.51 
 
 
211 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  42.08 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  46 
 
 
218 aa  181  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  47.4 
 
 
212 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  43.3 
 
 
213 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  48.33 
 
 
215 aa  177  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  46.5 
 
 
219 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  45.45 
 
 
252 aa  175  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  43.78 
 
 
209 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  43.01 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  46.67 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  43.96 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  43.41 
 
 
201 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  48.54 
 
 
222 aa  168  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  43.5 
 
 
211 aa  165  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  39.52 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  44.83 
 
 
190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  40.68 
 
 
212 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  44.07 
 
 
220 aa  151  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  39.32 
 
 
212 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  39.71 
 
 
204 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  39 
 
 
211 aa  148  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  38.97 
 
 
202 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  39.43 
 
 
198 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  36.36 
 
 
198 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  36.36 
 
 
216 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  36.36 
 
 
198 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  36.36 
 
 
198 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  36 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  36 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  35.43 
 
 
198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  38.86 
 
 
198 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  38.86 
 
 
198 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  38.86 
 
 
198 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  38.86 
 
 
198 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  38.86 
 
 
198 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  38.86 
 
 
198 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2367  hypothetical protein  38.86 
 
 
198 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  36.27 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  33.68 
 
 
217 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  35.67 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  28.28 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  29.61 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  31.4 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  28.85 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  30.65 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  30.65 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  30.65 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  30.65 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  30.65 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  28.1 
 
 
222 aa  91.3  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  28.18 
 
 
222 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  27.18 
 
 
202 aa  88.2  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  27.18 
 
 
202 aa  88.2  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  29.05 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  26.57 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  29.15 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  29.15 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  29.15 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  29.15 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  29.81 
 
 
209 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  29.15 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  31.25 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  31.25 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  31.25 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  23.5 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  29.15 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  29.15 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  29.29 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  28.64 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  22.97 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  22.97 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  22.89 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  22.97 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>