43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1290 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1290  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1834  toluene tolerance family protein  38.76 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  25.44 
 
 
227 aa  82  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0975  toluene tolerance family protein  28.65 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475076  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3762  toluene tolerance family protein  24.26 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.990585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3453  toluene tolerance family protein  24.26 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal  0.12161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3651  toluene tolerance family protein  24.32 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0501404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  24.46 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7152  toluene tolerance family protein  30.05 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  23.04 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  23.04 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  28.71 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  21.71 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0056  toluene tolerance  24.5 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.171728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  26.67 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  26.32 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  24.64 
 
 
224 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  24.3 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  27.34 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  23.62 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  25.17 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  25.17 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  25.17 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  25.17 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  25.17 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  25.17 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.21 
 
 
201 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  24.48 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  25 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  26.13 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  23.12 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  27.27 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1331  toluene tolerance family protein  25.68 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258778  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0404  toluene tolerance family protein  24.16 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  23.74 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0221  toluene tolerance family protein  24.84 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  20.97 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  26.57 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  26.02 
 
 
220 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4019  toluene tolerance family protein  27.01 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163851  normal  0.13623 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  22.82 
 
 
198 aa  42  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  25.42 
 
 
198 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  25.42 
 
 
198 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>