165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0806 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  36.71 
 
 
208 aa  155  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  40.53 
 
 
227 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  36.99 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  36.99 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0056  toluene tolerance  28.4 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.171728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  30.94 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  25.62 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  30.86 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  24.27 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  24.21 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1834  toluene tolerance family protein  28.14 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  24.87 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  27.6 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  26.55 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  29.41 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  24.62 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  26.06 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  27.86 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  22.29 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  23.98 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  22.5 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  25.19 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  23.16 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  21.88 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4533  toluene tolerance family protein  25.55 
 
 
257 aa  61.6  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  28.32 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  26.77 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  22.38 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  23.15 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  23.41 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0221  toluene tolerance family protein  24.62 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  24.06 
 
 
206 aa  58.2  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  23.65 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  25.36 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1290  hypothetical protein  21.71 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  24.22 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  26.45 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  25.26 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  22.16 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  22.16 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  25.62 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  23.5 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  21.97 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  25.66 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  23.39 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  25.77 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  25.42 
 
 
217 aa  55.1  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  22.82 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1282  toluene tolerance  21.28 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  22.58 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  24.86 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  23.26 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  25.78 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  24.18 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  26.72 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  23.97 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  25.12 
 
 
211 aa  51.6  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  21.57 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  20.22 
 
 
193 aa  51.6  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  25.13 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  26.04 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  25.49 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  25 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  22.75 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  21.77 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  18.4 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6337  toluene tolerance family protein  23.4 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  22.45 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  25.58 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7152  toluene tolerance family protein  25 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  22.31 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  23.53 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  22.03 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  21.05 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  21.32 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  21.61 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  21.61 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  22.48 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  22.31 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  22.31 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0508  toluene tolerance protein Ttg2  22.95 
 
 
213 aa  48.9  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  22.38 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3118  toluene tolerance family protein  25.9 
 
 
175 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00282764  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  22.07 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  22.07 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  23.97 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  23.97 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  22.07 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  22.07 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  22.07 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  22.07 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  22.56 
 
 
209 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  21.26 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  22.58 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  22.8 
 
 
201 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  21.97 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  23.15 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  23.15 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  23.15 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>