174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3078 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  76.72 
 
 		 217 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  67.43 
 
 		 221 aa  308  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  76.32 
 
 		 217 aa  307  9e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  75.79 
 
 		 217 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  75.66 
 
 		 217 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  70 
 
 		 220 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  69.52 
 
 		 220 aa  304  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  70 
 
 		 220 aa  304  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  70 
 
 		 220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  64.42 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  64.11 
 
 		 222 aa  275  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  61.95 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  60.19 
 
 		 217 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  58.22 
 
 		 220 aa  261  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  56.74 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4533  toluene tolerance family protein  50.27 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2099  hypothetical protein  51.46 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0508  toluene tolerance protein Ttg2  47.76 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002412  uncharacterized ABC transporter auxiliary component YrbC  44.33 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  41.71 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  40.7 
 
 		 217 aa  164  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  39.81 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  37.86 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  37.38 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03655  hypothetical protein  46.74 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  40 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  38.35 
 
 		 209 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  39.09 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  37.86 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  37.86 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  37.86 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  36.89 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  36.41 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  36.41 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  36.41 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  36.41 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  36.41 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  36.41 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  36.41 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  36.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  36.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  36.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  36.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  36.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  39.43 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  36.32 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  34.54 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  33.58 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  26.26 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  28.14 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  28.14 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  32.35 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  25.89 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  26.44 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  25.89 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  25.53 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  26.29 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  26.16 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  24.61 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  27.37 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  25.26 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  23.91 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  28.09 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  24.75 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  24.75 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  24.75 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  21.81 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  22.97 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  24.24 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  24.24 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  24.24 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  24.04 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  23.98 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  23.74 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  20.77 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  23.76 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  25.13 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  23.62 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  22.68 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  27.27 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  24.74 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  24.42 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  21.78 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  25.26 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  18.41 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  23.35 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  28.89 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  22.22 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  21.59 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  24.23 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  23.35 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  25.5 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  22.51 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  25.5 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  22.67 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  23.62 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  22.84 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  22.84 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>