151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4533 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4533  toluene tolerance family protein  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0508  toluene tolerance protein Ttg2  50.54 
 
 		 213 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  46.04 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  50.27 
 
 		 212 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  45.54 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  45.05 
 
 		 220 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  45.05 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  47.29 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  46.8 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  45.18 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  45.81 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  46.07 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  44.83 
 
 		 217 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  48.6 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  44.62 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03655  hypothetical protein  47.59 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  46.2 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  45.69 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002412  uncharacterized ABC transporter auxiliary component YrbC  44.44 
 
 		 212 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  45.2 
 
 		 221 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  41.4 
 
 		 213 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  46.45 
 
 		 217 aa  168  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  44.5 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2099  hypothetical protein  43.3 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  40 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  39.89 
 
 		 211 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  39.36 
 
 		 211 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  39.36 
 
 		 211 aa  159  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  39.36 
 
 		 211 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  39.36 
 
 		 211 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  39.36 
 
 		 211 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  39.36 
 
 		 211 aa  158  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  39.36 
 
 		 211 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  39.36 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  38.83 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  38.83 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  38.83 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  38.83 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  38.83 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  37.23 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  39.78 
 
 		 207 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  37.57 
 
 		 209 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  39.78 
 
 		 207 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  39.78 
 
 		 207 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  36.7 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  36.7 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  40 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  32.07 
 
 		 208 aa  103  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  27.49 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  25.29 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  24.59 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  24.59 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  27.07 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  20.73 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  26.32 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  25 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  24.44 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  24.72 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  24.72 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  24.44 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  24.44 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  24.44 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  24.44 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  24.44 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  25.63 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  25.3 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  23.7 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  24.83 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  22.47 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  25.83 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  23.81 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  23.86 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  29.13 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  23.89 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  25.14 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  25.14 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  22.98 
 
 		 213 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  25.14 
 
 		 210 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  24.04 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  20.86 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  23.33 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  24.59 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  24.73 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  24.59 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  25.54 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4019  toluene tolerance family protein  26.67 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163851  normal  0.13623 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  23.78 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  26.15 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  25.58 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  22.53 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  26.83 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  26.83 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  23.35 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  18.54 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  25.13 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  20.37 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  28.33 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  22.55 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  20.83 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  20.83 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>