190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0740 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  100 
 
 
215 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  55.74 
 
 
222 aa  201  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  36.36 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  35.24 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  35.8 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  36.14 
 
 
213 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  31.58 
 
 
202 aa  118  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  31.58 
 
 
202 aa  118  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  38.1 
 
 
220 aa  117  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  32.11 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  29.74 
 
 
204 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  32.18 
 
 
204 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  32.5 
 
 
212 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  30.33 
 
 
217 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  30.91 
 
 
210 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  34.36 
 
 
211 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  27.78 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  28.49 
 
 
217 aa  99  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  31.66 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  28.16 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  31.47 
 
 
221 aa  97.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  28.16 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  28.16 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  29.61 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  33.13 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  26.19 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  27.67 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  27.67 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  27.67 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  29.09 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  27 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  26.19 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  32.81 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  25.37 
 
 
217 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  26.5 
 
 
220 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  27 
 
 
220 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  26.5 
 
 
220 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  25.37 
 
 
217 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  28.78 
 
 
209 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  34.78 
 
 
215 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  35.4 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  28.41 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  28.5 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  33.33 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  32.83 
 
 
219 aa  92  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  27.27 
 
 
208 aa  91.7  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  30 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  28.32 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  29.21 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  30 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  26.26 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  27.91 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  30.1 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  29.61 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  25.77 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  31.85 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  29.78 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  24.49 
 
 
217 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  24.49 
 
 
217 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  28.73 
 
 
211 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  28.64 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  23.7 
 
 
217 aa  88.2  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  25.91 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  33.54 
 
 
213 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  33.14 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  29.48 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  28.16 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  21.89 
 
 
213 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  28.16 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  23.83 
 
 
211 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  26.59 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  28.16 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  28.06 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  25.63 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  33.54 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2706  toluene tolerance family protein  29.8 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  29.53 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  28.16 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  33.54 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  27.67 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  28.42 
 
 
200 aa  85.1  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  26.06 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  27.67 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  30.05 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  21.28 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  29.33 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  31.64 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0961  toluene tolerance family protein  30.25 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  24.87 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  24.87 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  24.87 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  24.87 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  24.87 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  23.89 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1000  toluene tolerance family protein  30.25 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  23.37 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  29.28 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  30.77 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  31.19 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>