187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3236 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  96.68 
 
 		 211 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  85.31 
 
 		 211 aa  359  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  53.88 
 
 		 209 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  49.51 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  49.03 
 
 		 208 aa  207  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  50.25 
 
 		 210 aa  205  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  50.24 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  48.33 
 
 		 210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  48.33 
 
 		 210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  48.33 
 
 		 210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  48.33 
 
 		 210 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  48.33 
 
 		 210 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  48.33 
 
 		 210 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  49.53 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  50.25 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  52.51 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  48.57 
 
 		 210 aa  194  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  51.1 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  47.09 
 
 		 211 aa  193  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  46.67 
 
 		 204 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  48.08 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  48.06 
 
 		 212 aa  191  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  49.18 
 
 		 190 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  49.71 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  49.52 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  47.78 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  47.78 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  45.81 
 
 		 201 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  45.81 
 
 		 201 aa  177  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  45.81 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  44.34 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  44.1 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  49.05 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  48.57 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  48.57 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  48.57 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  48.57 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  48.57 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  44.67 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  45.81 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  41.51 
 
 		 204 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  45.36 
 
 		 209 aa  168  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  46.67 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  39.41 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  41.92 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  38.58 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  40.66 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  41.76 
 
 		 198 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  41.76 
 
 		 198 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  41.76 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  39.88 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  40.48 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  40.7 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  41.18 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  39.29 
 
 		 198 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  41.67 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  41.67 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2367  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  35.58 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  35.61 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  30.95 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  30.69 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  34.1 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  28.65 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  26.52 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  26.52 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  29.47 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  29.95 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  27.89 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  29.1 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  32.66 
 
 		 200 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  28.57 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  30.98 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  25.42 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  30.57 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  29.65 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  29.65 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  25.85 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  28.57 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  28.57 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  22.22 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  25.79 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  25 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  25.84 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  27.93 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  25.84 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  25.84 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  25.84 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  25.84 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  26.27 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  26.27 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  26.27 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  26.27 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  26.32 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  26.27 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>