178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1006 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  100 
 
 
193 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  37.89 
 
 
210 aa  141  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  39.06 
 
 
214 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  38.46 
 
 
215 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  34.5 
 
 
234 aa  118  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  36.41 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  33.68 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  34.12 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  33.16 
 
 
199 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  30.16 
 
 
202 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  35.86 
 
 
212 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  31.09 
 
 
200 aa  101  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  29.69 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  28.87 
 
 
224 aa  91.3  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  28.57 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  24.47 
 
 
191 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  31.12 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  29.32 
 
 
211 aa  82  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  29.58 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  29.59 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  27.36 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  27.36 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  26.15 
 
 
202 aa  79  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0404  toluene tolerance family protein  31.61 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  30.89 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1375  toluene tolerance protein, putative  28.34 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  25.82 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3118  toluene tolerance family protein  23.78 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00282764  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  25.82 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1564  toluene tolerance protein, putative  28.34 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.831051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  26.29 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  27.66 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  27.66 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2201  toluene tolerance protein Ttg2D  25.91 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0278  putative toluene tolerance protein  27.27 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  24.62 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  24.49 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  28.99 
 
 
214 aa  67.8  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  27.12 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  26.9 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1280  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  25.26 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  25.42 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  24.86 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  25.42 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  25.42 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  25.42 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  25.42 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  28.31 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  25.42 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  28.31 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  25.5 
 
 
221 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  26.8 
 
 
204 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  23.08 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  25.7 
 
 
217 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  23.47 
 
 
213 aa  61.6  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  27.64 
 
 
198 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0221  toluene tolerance family protein  29.56 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  25.23 
 
 
210 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0365  toluene tolerance protein Ttg2D  26.09 
 
 
199 aa  61.2  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1282  toluene tolerance  31.18 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0320  toluene tolerance protein Ttg2D  27.78 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.650296  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  24.28 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  25.37 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  25.37 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  25.37 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  25.37 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  25.37 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  26.17 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  26.17 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  26.17 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  25.37 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  22.94 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  25.37 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  22.4 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  24.82 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  23.2 
 
 
201 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  24.88 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  23.12 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  25.7 
 
 
210 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  28.91 
 
 
212 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  25.7 
 
 
210 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  25.7 
 
 
210 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  29.63 
 
 
211 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1575  toluene tolerance family protein  23.32 
 
 
223 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  23.18 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  24.38 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  24.38 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  24.38 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  29.94 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  24.38 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  24.38 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  22.68 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  26.83 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  26.83 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  22.75 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  26.83 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  26.83 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  26.83 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  26.83 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>