153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0968 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  90.32 
 
 		 217 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0961  toluene tolerance family protein  95.81 
 
 		 215 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1000  toluene tolerance family protein  96.28 
 
 		 215 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  73.73 
 
 		 216 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0866  toluene tolerance  73.73 
 
 		 216 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4444  toluene tolerance protein, putative  73.68 
 
 		 216 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  66.99 
 
 		 215 aa  291  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12880  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, auxiliary component  69.71 
 
 		 215 aa  278  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0879  toluene tolerance family protein  69.61 
 
 		 209 aa  271  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  65.98 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  40.31 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2706  toluene tolerance family protein  35.92 
 
 		 217 aa  118  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  34.02 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  29.03 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  29.03 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2410  toluene tolerance family protein  32.77 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.136848  normal  0.157116 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  32.72 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  30.43 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  30.7 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  29.81 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  30.49 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  30.25 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  28.04 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  28.24 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  29.06 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  29.35 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  26.75 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  30.21 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  28.42 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  28.93 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  26.74 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  26.74 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  27.04 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  26.11 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  29.28 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  31.71 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  27.72 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  29.21 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  24.36 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  27.43 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  29.65 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  29.21 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  26.63 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  24.46 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  26.64 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  29.73 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  22.4 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4019  toluene tolerance family protein  27.33 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163851  normal  0.13623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  28.12 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  24.46 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  26.7 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  27.68 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  29.15 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  26.79 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  25.25 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  27.81 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  26 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  22.75 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  26.18 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  23.49 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  23.98 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  28.95 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  24.24 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  27.22 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  28.95 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  25.57 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  25.65 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  25.49 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  25.49 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  25.49 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  22.81 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  26.21 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  25.45 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  23.47 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  24.54 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  23.47 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  25.27 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  25.27 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  25.27 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  22.58 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  21.47 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  22.28 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  25.15 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  22.28 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  22.28 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  22.28 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  32.79 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  22.28 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  25.14 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  25.45 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  28.96 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  22.83 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  25.85 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  19.9 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  22.78 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  24.86 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  22.83 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  22.83 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>