96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0879 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0879  toluene tolerance family protein  100 
 
 		 209 aa  430  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  67.8 
 
 		 215 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  66.5 
 
 		 217 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  63.9 
 
 		 215 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12880  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, auxiliary component  68.93 
 
 		 215 aa  279  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  61.95 
 
 		 216 aa  279  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0961  toluene tolerance family protein  69.27 
 
 		 215 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1000  toluene tolerance family protein  69.27 
 
 		 215 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  65.1 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4444  toluene tolerance protein, putative  61.98 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0866  toluene tolerance  61.29 
 
 		 216 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2706  toluene tolerance family protein  38.73 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  37.25 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2410  toluene tolerance family protein  35.38 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.136848  normal  0.157116 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  34.03 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  33.52 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  29.19 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  29.19 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  30.65 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  30.26 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  33.15 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  32.56 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  31.21 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  28.48 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  29.38 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  25.65 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  25 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  29.94 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  29.94 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  27.37 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  27.37 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  28.26 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  27.87 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  28.26 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  27.37 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  29.51 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  28.04 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  28.65 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  27.87 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  28.26 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  22.83 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  22.83 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  26.7 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  27.96 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  35 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  28.81 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  24.88 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  25.14 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  33.62 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4019  toluene tolerance family protein  28.66 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163851  normal  0.13623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  34.62 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  33.62 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  30.63 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  24.19 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  26.25 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  31.3 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  28.81 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  31.09 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  24.42 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  23.96 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  23.43 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  24.26 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  23.24 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  25.73 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  25.73 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  25.73 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  25.73 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  25.73 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  21.91 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1575  toluene tolerance family protein  21.81 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  23.46 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  21.95 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  25 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  24.02 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  21.79 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  23.24 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1280  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  23.43 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  24.04 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  29.51 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  29.51 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  29.51 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  25.29 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  29.51 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  21.52 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  25.29 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  29.51 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  29.51 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  23.56 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  28.42 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  22.22 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  27.43 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  23.67 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2201  toluene tolerance protein Ttg2D  24.18 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  21.43 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  24.38 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  23.49 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>