131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_12880  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, auxiliary component  100 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  66.98 
 
 
215 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  69.71 
 
 
215 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  70 
 
 
217 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  66.83 
 
 
216 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  66.33 
 
 
215 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0961  toluene tolerance family protein  72.06 
 
 
215 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1000  toluene tolerance family protein  70.67 
 
 
215 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0879  toluene tolerance family protein  69.61 
 
 
209 aa  276  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4444  toluene tolerance protein, putative  65.2 
 
 
216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0866  toluene tolerance  64.15 
 
 
216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2706  toluene tolerance family protein  34.62 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  37.69 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  35.38 
 
 
203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2410  toluene tolerance family protein  34.48 
 
 
205 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.136848  normal  0.157116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  31.44 
 
 
219 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  31.75 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  27.03 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  27.03 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  31.55 
 
 
217 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  30.32 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  31.52 
 
 
213 aa  79  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  28.49 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  26.86 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  27.43 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  27.32 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  26.8 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  26.26 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  27.62 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  25.24 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  28.8 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  27.43 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  25.9 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  25.26 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  25.26 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  24.57 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  26.51 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  27.91 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  25.84 
 
 
215 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  27.72 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  25.23 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  25.14 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  25.84 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  26.25 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  26.25 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  26.29 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4019  toluene tolerance family protein  27.5 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163851  normal  0.13623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  26.67 
 
 
209 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  24.71 
 
 
210 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  26.25 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  26.88 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  24.54 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  29.41 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  29.41 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  26.88 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  24.08 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  25.29 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  27.42 
 
 
198 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  26.37 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  24.66 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  24.71 
 
 
190 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  21.43 
 
 
217 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  23.24 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  23.78 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  22.28 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  22.35 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  22.56 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  22.51 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  21.32 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  21.32 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  22.22 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  21.32 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  21.32 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  21.32 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  22.16 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  22.22 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  20.92 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  23.78 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  23.37 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  23.97 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  23.78 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  30.1 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  20.97 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  27.72 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  25.93 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  25.93 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  25.93 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  25.93 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  28.47 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  25.93 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.13 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  25.93 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  23.2 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  25.93 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  25.93 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  24.02 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  21.47 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  26.83 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  26.89 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  23.24 
 
 
201 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>