73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2410 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2410  toluene tolerance family protein  100 
 
 
205 aa  411  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.136848  normal  0.157116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  40.35 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  40.35 
 
 
215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0879  toluene tolerance family protein  36.52 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  37.84 
 
 
221 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  30.88 
 
 
216 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12880  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, auxiliary component  34.48 
 
 
215 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4444  toluene tolerance protein, putative  32.58 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0961  toluene tolerance family protein  32.04 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1000  toluene tolerance family protein  32.04 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  32.77 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  32.22 
 
 
217 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0866  toluene tolerance  32.97 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  31.79 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2706  toluene tolerance family protein  28.75 
 
 
217 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  32.09 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  28.48 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  25 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  28 
 
 
202 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  29.45 
 
 
213 aa  58.2  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  26.54 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  26.44 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  29.08 
 
 
211 aa  54.7  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  24.2 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  27.89 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  27.1 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  25.78 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  25.78 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  22.83 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  22.83 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  25.48 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  27.01 
 
 
213 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  21.69 
 
 
221 aa  52  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  23.65 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  22.58 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  26.4 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  22.4 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  21.84 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  26.24 
 
 
190 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  21.84 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  25.75 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  23.42 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  25.56 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  24.84 
 
 
222 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  21.62 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  25.68 
 
 
218 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  25.68 
 
 
218 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  24.7 
 
 
218 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  23.33 
 
 
206 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  20.61 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  21.66 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  27.08 
 
 
220 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4019  toluene tolerance family protein  25.17 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163851  normal  0.13623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  25.35 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  25 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  24.11 
 
 
220 aa  44.7  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  26.83 
 
 
212 aa  44.7  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  27.34 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  23.91 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  20.43 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  29.27 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  23.02 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  22.7 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  38 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  24.2 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  26.56 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  23.68 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  23.23 
 
 
211 aa  42  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  27.73 
 
 
211 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  21.14 
 
 
198 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  23.75 
 
 
199 aa  41.6  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  22.08 
 
 
211 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  21.88 
 
 
209 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>