153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_57840 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  440  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  98.14 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  66.99 
 
 		 215 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  67.62 
 
 		 217 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12880  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, auxiliary component  66.98 
 
 		 215 aa  285  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  60.56 
 
 		 216 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1000  toluene tolerance family protein  65.55 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0961  toluene tolerance family protein  65.55 
 
 		 215 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0879  toluene tolerance family protein  63.9 
 
 		 209 aa  258  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4444  toluene tolerance protein, putative  58.82 
 
 		 216 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0866  toluene tolerance  58.53 
 
 		 216 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  38.65 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2706  toluene tolerance family protein  36.41 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2410  toluene tolerance family protein  40.35 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.136848  normal  0.157116 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  32.12 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  34.52 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  30.98 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  26.55 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  26.55 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  29.76 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  29.33 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  32.91 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  28.8 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  30.46 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  29.65 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  30.46 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  24.46 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  28.66 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  30.38 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  26.97 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  29.75 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  28.41 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  29.19 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  28.49 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  31.29 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  29.11 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  28.48 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  26.06 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  26.59 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  29.25 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  28.95 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  27.33 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  24.73 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  26.16 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  26.98 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  29.94 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  28.72 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4019  toluene tolerance family protein  28.95 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163851  normal  0.13623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  28.33 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  29.82 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  25.14 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  27.54 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  27.95 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  27.54 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  29.27 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  25.47 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  29.27 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  23.08 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  26.14 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  25.99 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  22 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  29.68 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  29.68 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  22.5 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  25.79 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  27.13 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  23.17 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.04 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  27.98 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  24.07 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  25.4 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  23.53 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  26.15 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  24.02 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  23.44 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  21.95 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  24.24 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  24.55 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  24.31 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0320  toluene tolerance protein Ttg2D  26.29 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.650296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  23.66 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  23.53 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  22.51 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1280  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  25.14 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2201  toluene tolerance protein Ttg2D  24.08 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  23.35 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  22.53 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  25.63 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  22.1 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  22.6 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  22.46 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  22.99 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  28.46 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  24.21 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  23.08 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  23.6 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  23.6 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  23.78 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>