189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0451 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  37.5 
 
 
199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  36.63 
 
 
200 aa  131  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  35.29 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  33.18 
 
 
234 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  36.36 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  35.03 
 
 
214 aa  118  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  31.71 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  33.5 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  33.5 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  36.16 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  33.85 
 
 
201 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  35.47 
 
 
218 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  32.45 
 
 
215 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  33.5 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  35 
 
 
193 aa  98.2  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  34.98 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  31.61 
 
 
202 aa  92  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  34.69 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  31.52 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  28.14 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3118  toluene tolerance family protein  30.56 
 
 
175 aa  85.1  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00282764  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  30.61 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  29.26 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  30.16 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  34.39 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  28.91 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  26.7 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  29.88 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  29.11 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  30.86 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  31.92 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  28.87 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  31.68 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  27.94 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  27.94 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  26.6 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  26.6 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  28.05 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0404  toluene tolerance family protein  25.65 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  28.05 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1564  toluene tolerance protein, putative  25 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.831051  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  28.37 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  28.37 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  25.84 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1375  toluene tolerance protein, putative  24.46 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  25 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0278  putative toluene tolerance protein  26.06 
 
 
189 aa  72  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  26.07 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  27.32 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  31.29 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  30 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  29.76 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  27.12 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  27.68 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  25.24 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  25.24 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  25.24 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  28.72 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  28.72 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  27.57 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  26.7 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  28 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2201  toluene tolerance protein Ttg2D  25.26 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  32.58 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  24.76 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  22.17 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  24.76 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  24.76 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  27.1 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  23.49 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  27.35 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  26.9 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  30.72 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  30.3 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  25.99 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  27.7 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.83 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  28.72 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  28.86 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  32.67 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  27.92 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  30.72 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  32 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  28.77 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  25.35 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  25.35 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  25.35 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  22.07 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  25.24 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  30.39 
 
 
213 aa  61.6  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  26.29 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  28.29 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  26.05 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  24.88 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  23.16 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  24.88 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  30 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>