68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2034 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2034  toluene tolerance family protein  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.601085  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0117  toluene tolerance family protein  54.85 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.268092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2549  toluene tolerance family protein  56.52 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0890  hypothetical protein  56.52 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2481  toluene tolerance  50.52 
 
 		 196 aa  191  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.996005  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  51.06 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0221  toluene tolerance family protein  25.16 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  25 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  24.37 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1331  toluene tolerance family protein  24.84 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  24.73 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  22.14 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  24.18 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  24.18 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  24.75 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  24.18 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  24.18 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  24.18 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  24.18 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  24.18 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0508  toluene tolerance protein Ttg2  26.32 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1575  toluene tolerance family protein  24.14 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1155  toluene tolerance family protein  21.71 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  25 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  25.37 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  24.37 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2099  hypothetical protein  24.87 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  25.55 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  22.22 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  26.47 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  23.63 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  23.63 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  23.63 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  23.63 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  23.63 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  21.83 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  23.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  23.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  26.32 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  21.39 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  21.39 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  21.39 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  23.98 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  25.41 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  22.8 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  25.37 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  24.59 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  22.11 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  24.59 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  23.44 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  26.49 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  24.59 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  24.59 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  24.59 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4533  toluene tolerance family protein  25.2 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  25.41 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  25.41 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  24.59 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0442  toluene tolerance family protein  19.23 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  23.31 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  24.59 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  24.59 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002412  uncharacterized ABC transporter auxiliary component YrbC  21.11 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  22.58 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  23.48 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  24.12 
 
 		 202 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  21.05 
 
 		 217 aa  42  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  21.59 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>