52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0890 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0890  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2549  toluene tolerance family protein  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0117  toluene tolerance family protein  88.89 
 
 		 207 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.268092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2034  toluene tolerance family protein  56.8 
 
 		 201 aa  221  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.601085  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2481  toluene tolerance  51.53 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.996005  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  52.24 
 
 		 206 aa  195  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0221  toluene tolerance family protein  23.68 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1155  toluene tolerance family protein  24.16 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1575  toluene tolerance family protein  24.17 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  27.74 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1331  toluene tolerance family protein  22.88 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  25.12 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  27.01 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  27.01 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  27.01 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  27.01 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  27.01 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  27.01 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  27.01 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  26.76 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  22.96 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  23.13 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  26.28 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  20.97 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  22.04 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  22.06 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  25.4 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  25 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  22.06 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  24.07 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  23.08 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  25.55 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  25.55 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  25.55 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  25.55 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  25.55 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002412  uncharacterized ABC transporter auxiliary component YrbC  24.76 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  25.19 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  22.61 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  26.15 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  21.74 
 
 		 207 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  21.74 
 
 		 207 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  23.08 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  21.74 
 
 		 207 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  25.2 
 
 		 220 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2099  hypothetical protein  21.64 
 
 		 213 aa  42  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  21.02 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  24 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  22.31 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  22.61 
 
 		 220 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  22.61 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  22.61 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>