75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2578 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  100 
 
 		 242 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  86.38 
 
 		 237 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  46.06 
 
 		 251 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  45.19 
 
 		 236 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  46.46 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  44.49 
 
 		 264 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  41.63 
 
 		 256 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  41.63 
 
 		 256 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  41.35 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  42.08 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  43.78 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  41.77 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  42.17 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  38.96 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  43.04 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  40.16 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  35.93 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  92.86 
 
 		 85 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  38.67 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  37.99 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  38.43 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  38.22 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  37.33 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  37.33 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  36.52 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  36.52 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  36.52 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  36.09 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  35.06 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  38.92 
 
 		 169 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  40.74 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  40.21 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  40.21 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  40.21 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  40.21 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  38.62 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  32.94 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  37.57 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  37.57 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  31.28 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  34.52 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  34 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  34 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  34 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  33.73 
 
 		 272 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  33.6 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.37 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.28 
 
 		 148 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  27.09 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.36 
 
 		 130 aa  52.4  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  31.76 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.23 
 
 		 155 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.23 
 
 		 155 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.48 
 
 		 146 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  21.91 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.91 
 
 		 139 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.84 
 
 		 153 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.61 
 
 		 133 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  27.45 
 
 		 151 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  26.45 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  26.45 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  36.05 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  26.45 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.25 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  27.62 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  28.93 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  31.19 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.97 
 
 		 136 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.62 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.17 
 
 		 142 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 		 133 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 		 138 aa  42.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  30.34 
 
 		 144 aa  42.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  29.29 
 
 		 165 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>