75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3098 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  100 
 
 		 236 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  96.61 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  72.53 
 
 		 236 aa  362  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  44.58 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  44.02 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  41.43 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  40.68 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  41.39 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  41.8 
 
 		 256 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  40 
 
 		 250 aa  177  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  38.78 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  37.39 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  36.99 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  33.74 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  38.22 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  37.66 
 
 		 247 aa  138  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  38.26 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  37.78 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  37.66 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  38.26 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  37.66 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  37.83 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  37.78 
 
 		 245 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  37.33 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  36.09 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  39.63 
 
 		 169 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  30.29 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  36.92 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  36.92 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  36.92 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  36.92 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  36.92 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  36.02 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  36.22 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  36.22 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  32.81 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  33.47 
 
 		 272 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 272 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  33.47 
 
 		 272 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  32.65 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  32.94 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  38.27 
 
 		 85 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  34.65 
 
 		 129 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  29.17 
 
 		 134 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.43 
 
 		 164 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.27 
 
 		 134 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.91 
 
 		 138 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  32.43 
 
 		 139 aa  48.5  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 		 148 aa  48.5  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.41 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.73 
 
 		 130 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.01 
 
 		 137 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.69 
 
 		 133 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.65 
 
 		 158 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.66 
 
 		 158 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  26.04 
 
 		 151 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.04 
 
 		 130 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.67 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.83 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.14 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.64 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.11 
 
 		 148 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.78 
 
 		 157 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 		 148 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.09 
 
 		 139 aa  42.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2021  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649005  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.37 
 
 		 157 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.93 
 
 		 136 aa  42  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3049  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  28.57 
 
 		 156 aa  42  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.24 
 
 		 138 aa  42  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>