48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5049 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  97.79 
 
 		 272 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  96.69 
 
 		 272 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  95.96 
 
 		 272 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  94.85 
 
 		 272 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  82.59 
 
 		 275 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  83.03 
 
 		 275 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  37.31 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  34.15 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  33.6 
 
 		 242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  34.54 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  35.06 
 
 		 250 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  35.23 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  34.77 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  33.06 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  34.77 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  34.77 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  33.47 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  34.77 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  34.38 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  34.88 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  34.77 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  33.57 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  33.81 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  36.41 
 
 		 211 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  36.41 
 
 		 211 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  36.41 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  36.41 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  34.84 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  42.31 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  34.33 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  34.43 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  35.94 
 
 		 211 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  34.02 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  32.46 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  40.77 
 
 		 169 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  38.55 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  32.65 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  32.02 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  39.63 
 
 		 199 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  39.63 
 
 		 199 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  32.23 
 
 		 236 aa  92.4  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  31.95 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  29.81 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  30 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  27.95 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  35.9 
 
 		 85 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>