71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2777 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  100 
 
 		 254 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  77.2 
 
 		 251 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  69.84 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  53.39 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  53.39 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  49.8 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  44.98 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  46.46 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  47.01 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  42.57 
 
 		 249 aa  218  5e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  44.58 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  42.57 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  41.06 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  40.84 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  39.31 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  33.74 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  37.85 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  34.38 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  33.2 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  35.39 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  34.98 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  32.93 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  34.55 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  32.93 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  33.61 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  33.61 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  32.53 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  32.79 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  32.52 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  33.52 
 
 		 169 aa  108  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  31.5 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  31.23 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  36.27 
 
 		 203 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  33.03 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  32.57 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  32.57 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  32.57 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  32.57 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  33.18 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  32.84 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  32.84 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  33.65 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  34.12 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  34.12 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  33.65 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  33.65 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.71 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.64 
 
 		 136 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.65 
 
 		 158 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.48 
 
 		 133 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.09 
 
 		 139 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  35.79 
 
 		 85 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.08 
 
 		 133 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  35.44 
 
 		 151 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.07 
 
 		 137 aa  49.3  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.84 
 
 		 142 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.3 
 
 		 130 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.41 
 
 		 157 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.56 
 
 		 139 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.11 
 
 		 138 aa  46.2  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.31 
 
 		 158 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.79 
 
 		 141 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  27.06 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  36.27 
 
 		 155 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.61 
 
 		 164 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  36.26 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  30.39 
 
 		 132 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.5 
 
 		 156 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.44 
 
 		 134 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  32.67 
 
 		 144 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>