69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2421 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  100 
 
 
264 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  71.6 
 
 
251 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  69.84 
 
 
254 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  54.18 
 
 
256 aa  268  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  53.78 
 
 
256 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  44.49 
 
 
242 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  45.06 
 
 
237 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  43.78 
 
 
236 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  45.42 
 
 
236 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  41.43 
 
 
236 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  40.64 
 
 
236 aa  195  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  37.7 
 
 
249 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  43.51 
 
 
250 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  41.95 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  42.37 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  39.84 
 
 
240 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  30.04 
 
 
250 aa  145  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  37.9 
 
 
245 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  34.94 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  37.5 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  36.59 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  36.73 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  36.89 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  36.48 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  36.33 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  34.96 
 
 
245 aa  125  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  35.92 
 
 
247 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  35.92 
 
 
247 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  35.25 
 
 
247 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  39.02 
 
 
203 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  29.17 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  36.32 
 
 
211 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  30.73 
 
 
169 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  35.85 
 
 
211 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  35.85 
 
 
211 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  35.85 
 
 
211 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  35.85 
 
 
211 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  33.45 
 
 
275 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  38.86 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  38.86 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  38.39 
 
 
272 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  37.91 
 
 
272 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  36.14 
 
 
199 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  36.14 
 
 
199 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  37.91 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  38.35 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.81 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  30 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  33 
 
 
151 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.43 
 
 
139 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.83 
 
 
137 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.32 
 
 
130 aa  45.8  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.81 
 
 
133 aa  45.4  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  34.65 
 
 
143 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  31.4 
 
 
134 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.93 
 
 
137 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  36.47 
 
 
129 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.52 
 
 
137 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.08 
 
 
142 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.09 
 
 
133 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 
155 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 
155 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
137 aa  42.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1100  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.23 
 
 
162 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.952576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.83 
 
 
148 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  29.81 
 
 
134 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.18 
 
 
134 aa  42  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1009  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.84 
 
 
151 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>