48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7022 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  100 
 
 
275 aa  554  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  95.26 
 
 
275 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  82.96 
 
 
272 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  83.7 
 
 
272 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  82.59 
 
 
272 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  82.59 
 
 
272 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  82.22 
 
 
272 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  32.94 
 
 
242 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  34.14 
 
 
237 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  37.45 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  35.22 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  35.11 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  35.8 
 
 
247 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  34.55 
 
 
245 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  34.9 
 
 
250 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  35.41 
 
 
247 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  43.08 
 
 
250 aa  106  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  34.15 
 
 
243 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  35.42 
 
 
250 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  35.41 
 
 
247 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  35.41 
 
 
247 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  35.41 
 
 
247 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  35.66 
 
 
247 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  35.83 
 
 
250 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  41.54 
 
 
169 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  35.41 
 
 
247 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  35.51 
 
 
245 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  35.1 
 
 
245 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  31.23 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  33.45 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  32.81 
 
 
236 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  32.37 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  36.27 
 
 
203 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  35.78 
 
 
211 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  35.78 
 
 
211 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  35.78 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  35.78 
 
 
211 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  35.78 
 
 
211 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  31.02 
 
 
236 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  40 
 
 
199 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  31.56 
 
 
256 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  32.93 
 
 
236 aa  92.4  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  29.43 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  32.33 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  27.71 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  38.27 
 
 
85 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>