48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5752 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  97.43 
 
 		 272 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  97.06 
 
 		 272 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  96.69 
 
 		 272 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  95.96 
 
 		 272 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  82.59 
 
 		 275 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  83.03 
 
 		 275 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  39.23 
 
 		 236 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  34.15 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  34 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  34.54 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  34.6 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  34.26 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  34.27 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  34.69 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  35.55 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 247 aa  109  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  35.16 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  35.16 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  35.98 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  35.27 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  35.16 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  35.16 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  35.27 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  34.85 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  36.87 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  36.87 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  36.87 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  36.87 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  34.56 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  35.66 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  34.7 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  35.25 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  33.47 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  36.41 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  40.36 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  30.16 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  32.23 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  39.63 
 
 		 199 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  39.63 
 
 		 199 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  31.72 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  39.23 
 
 		 169 aa  92  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  31.62 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  32.33 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  30.19 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  29 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  28.8 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  35.9 
 
 		 85 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>