56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1470 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  100 
 
 		 247 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  94.74 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  95.14 
 
 		 247 aa  493  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  94.33 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  94.33 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  86.94 
 
 		 247 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  86.12 
 
 		 247 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  87.08 
 
 		 245 aa  448  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  86.67 
 
 		 245 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  86.6 
 
 		 211 aa  391  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  86.6 
 
 		 211 aa  391  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  86.6 
 
 		 211 aa  391  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  86.6 
 
 		 211 aa  391  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  86.6 
 
 		 211 aa  391  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  92.46 
 
 		 199 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  92.46 
 
 		 199 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  75.21 
 
 		 243 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  75.21 
 
 		 245 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  75.5 
 
 		 203 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  42.06 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  39.09 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  40.61 
 
 		 236 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  33.78 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  38.52 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  39.02 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  36.09 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  36.4 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  37.83 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  37.04 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  36.73 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  36.86 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  32.65 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  33.2 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  33.91 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  45.83 
 
 		 169 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  32.93 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  34.63 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  36.72 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  35.27 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  34.88 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  35.27 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  34.5 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  25.37 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  39.24 
 
 		 85 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.57 
 
 		 138 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.67 
 
 		 164 aa  45.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  28.12 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.94 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.71 
 
 		 137 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.62 
 
 		 152 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.02 
 
 		 145 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  30.88 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>