73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2383 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  100 
 
 
236 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  96.61 
 
 
236 aa  484  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  72.53 
 
 
236 aa  360  9e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  42.57 
 
 
254 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  44.02 
 
 
236 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  41.35 
 
 
242 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  40.25 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  40.64 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  42.21 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  41.8 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  38.78 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  38.37 
 
 
250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  37.96 
 
 
250 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  42.54 
 
 
240 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  36.96 
 
 
250 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  34.57 
 
 
249 aa  156  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  37.4 
 
 
246 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  37.78 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  37.78 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  37.23 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  37.83 
 
 
247 aa  135  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  37.83 
 
 
247 aa  135  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  37.23 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  37.23 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  37.39 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  36.09 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  36.89 
 
 
245 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  37.33 
 
 
245 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  39.02 
 
 
169 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  29.05 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  36.41 
 
 
211 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  36.41 
 
 
211 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  36.41 
 
 
211 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  36.41 
 
 
211 aa  105  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  36.41 
 
 
211 aa  105  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  34.95 
 
 
203 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  35.68 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  35.68 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  32.93 
 
 
275 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  32.64 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  32.23 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  32.23 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  32.23 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  31.84 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  32.54 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  38.27 
 
 
85 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  34.65 
 
 
129 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.27 
 
 
134 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  28.12 
 
 
134 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.43 
 
 
164 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
148 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.5 
 
 
137 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.27 
 
 
130 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  32.43 
 
 
139 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.01 
 
 
137 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 
137 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.3 
 
 
133 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.48 
 
 
145 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.67 
 
 
158 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.77 
 
 
130 aa  45.4  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.35 
 
 
157 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.14 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.11 
 
 
148 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.97 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.63 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  25 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
148 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  33.72 
 
 
134 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  32.26 
 
 
152 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1100  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.09 
 
 
162 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.952576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.11 
 
 
157 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.22 
 
 
136 aa  41.6  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>