95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1678 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  100 
 
 
148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  41.83 
 
 
153 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  41.18 
 
 
138 aa  111  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  46.76 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  35.81 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.41 
 
 
139 aa  104  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  37.67 
 
 
165 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.82 
 
 
158 aa  103  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  40.88 
 
 
140 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  46.15 
 
 
157 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.46 
 
 
155 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.46 
 
 
155 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  37.5 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  37.32 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.64 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.14 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  37.06 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  41.8 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0172  hypothetical protein  36.22 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.5 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  34.27 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  34.97 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  35.43 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.85 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0529  hypothetical protein  33.79 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.62 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  31.36 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  40.74 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  33.33 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  36.11 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.55 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.37 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  39.81 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  33.87 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  31.37 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.63 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.15 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.63 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  33.93 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.02 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3049  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  38.94 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.82 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
251 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  38.71 
 
 
254 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  27.21 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3836  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.43 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.818865  normal  0.112998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3924  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.43 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0381  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0397123  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3850  Mov34/MPN/PAD-1  30.43 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.19 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1965  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.26 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552168  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  32.73 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1696  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.41 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0603262  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1009  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.05 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  30.48 
 
 
242 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  31.43 
 
 
237 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  28.18 
 
 
249 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16881  hypothetical protein  24.66 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1289  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.61 
 
 
141 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.93 
 
 
137 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1725  Mov34/MPN/PAD-1  28.35 
 
 
138 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  0.175061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  27.94 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  30.83 
 
 
256 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1941  hypothetical protein  38.75 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.653496  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3873  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4293  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.98 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1140  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  25.17 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.811277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.8 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  28.57 
 
 
236 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  30 
 
 
256 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  27.21 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22901  hypothetical protein  35.14 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20141  hypothetical protein  23.18 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0620041  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
236 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.6 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0389  hypothetical protein  31.01 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.82 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1100  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.77 
 
 
162 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.952576 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  29.84 
 
 
250 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  28.45 
 
 
250 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.09 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.77 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0989  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.81 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2021  hypothetical protein  31.3 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649005  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.71 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4180  hypothetical protein  26.97 
 
 
177 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.921596  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  28.23 
 
 
250 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1539  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.23 
 
 
145 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>