94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2540 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  100 
 
 
139 aa  290  5e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  64.71 
 
 
136 aa  181  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  62.59 
 
 
138 aa  181  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  49.26 
 
 
132 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  48.48 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  45.93 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  43.8 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  42.75 
 
 
156 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  41.61 
 
 
133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  45.61 
 
 
136 aa  110  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.94 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.04 
 
 
146 aa  87  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.83 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3873  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.09 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.85 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.88 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  30.88 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0381  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.66 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0397123  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  30.88 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1289  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.63 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.88 
 
 
148 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.24 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  30.88 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1009  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.15 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1725  Mov34/MPN/PAD-1  28.06 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  0.175061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1696  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.15 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0603262  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1965  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.63 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552168  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.89 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.61 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  37.27 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.15 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1539  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.5 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3924  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.15 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3850  Mov34/MPN/PAD-1  30.15 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3836  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.15 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.818865  normal  0.112998 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.47 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  28.7 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.43 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  30.43 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.85 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4293  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.37 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.53 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0989  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.94 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.55 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1100  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.21 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.952576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  25.74 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.55 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.14 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.14 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.29 
 
 
153 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  29.79 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  28.78 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  29.03 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  34.29 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.77 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  28.08 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  29.01 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  28.7 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  29.17 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  33.67 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.36 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0529  hypothetical protein  31.25 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  31.09 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0172  hypothetical protein  28.08 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  37.5 
 
 
236 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1283  hypothetical protein  35.96 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1011  hypothetical protein  32.94 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.817258 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1835  hypothetical protein  37.93 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000551501 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  31.19 
 
 
250 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1941  hypothetical protein  45.45 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.653496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  31.43 
 
 
245 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0389  hypothetical protein  34.65 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  32.35 
 
 
245 aa  43.9  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  30 
 
 
251 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  33.7 
 
 
250 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22901  hypothetical protein  35.85 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2085  hypothetical protein  38.2 
 
 
124 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.141987 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16881  hypothetical protein  29.33 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  36.78 
 
 
247 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  30.3 
 
 
237 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3049  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  32.63 
 
 
156 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  29.76 
 
 
236 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  31.31 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  28.57 
 
 
254 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  34.41 
 
 
256 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  34.78 
 
 
247 aa  40  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.72 
 
 
142 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>