67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1356 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  100 
 
 
157 aa  316  7e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  78.87 
 
 
148 aa  223  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3873  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  76.03 
 
 
137 aa  215  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  73.43 
 
 
135 aa  214  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  72.85 
 
 
152 aa  214  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0381  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  75.89 
 
 
144 aa  212  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0397123  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0989  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  67.47 
 
 
162 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1100  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  66.87 
 
 
162 aa  207  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.952576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  71.83 
 
 
134 aa  205  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  70.34 
 
 
137 aa  205  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1725  Mov34/MPN/PAD-1  73.05 
 
 
138 aa  205  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  0.175061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  70.42 
 
 
137 aa  202  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  69.72 
 
 
148 aa  198  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1965  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  70.21 
 
 
135 aa  197  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  76.34 
 
 
152 aa  197  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  67.59 
 
 
137 aa  194  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1009  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  67.59 
 
 
151 aa  192  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1289  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  65.73 
 
 
141 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3836  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  66.9 
 
 
137 aa  190  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.818865  normal  0.112998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3924  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  66.9 
 
 
137 aa  190  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3850  Mov34/MPN/PAD-1  66.9 
 
 
137 aa  190  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1539  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  64.05 
 
 
145 aa  189  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1696  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  64.58 
 
 
136 aa  186  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0603262  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4293  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  70.45 
 
 
137 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  53.42 
 
 
159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.29 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  33.57 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.51 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.8 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  29.86 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.97 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.46 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.18 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.99 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.79 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.34 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.28 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.86 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  30.37 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.69 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.5 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.21 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.41 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.08 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.55 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.34 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  22.92 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.08 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  32.35 
 
 
236 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.77 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  32.67 
 
 
245 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  35.63 
 
 
247 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  25.83 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  29.32 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  31.37 
 
 
247 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  31.37 
 
 
247 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4180  hypothetical protein  34.34 
 
 
177 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.921596  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  31.37 
 
 
236 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  31.68 
 
 
245 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  34.48 
 
 
247 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  31.37 
 
 
247 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  29.91 
 
 
256 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  24.83 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  26.98 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  27.33 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  31.37 
 
 
247 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>