16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4180 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4180  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  360  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.921596  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2021  hypothetical protein  36.11 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649005  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  25.97 
 
 
155 aa  54.3  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  27.22 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.49 
 
 
133 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.42 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.42 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  30.43 
 
 
159 aa  44.7  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.86 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.58 
 
 
133 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  30.83 
 
 
152 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.97 
 
 
148 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34 
 
 
157 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.36 
 
 
164 aa  42  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  24.84 
 
 
153 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.23 
 
 
148 aa  41.2  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>