77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  100 
 
 
152 aa  309  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1009  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  70 
 
 
151 aa  215  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  76.3 
 
 
148 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  72.79 
 
 
135 aa  206  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1965  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  74.63 
 
 
135 aa  204  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1289  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  72.06 
 
 
141 aa  203  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  71.74 
 
 
137 aa  203  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3873  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  75.36 
 
 
137 aa  202  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3836  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  71.01 
 
 
137 aa  199  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.818865  normal  0.112998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3924  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  71.01 
 
 
137 aa  199  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3850  Mov34/MPN/PAD-1  71.01 
 
 
137 aa  199  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  74.64 
 
 
137 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0989  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  67.11 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  72.85 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0381  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  69.63 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0397123  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  73.33 
 
 
148 aa  195  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  70.37 
 
 
134 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4293  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  74.4 
 
 
137 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1100  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  66.45 
 
 
162 aa  191  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.952576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  64.49 
 
 
137 aa  188  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1725  Mov34/MPN/PAD-1  70.59 
 
 
138 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  0.175061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1696  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  64.96 
 
 
136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0603262  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  68.7 
 
 
152 aa  174  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1539  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  63.77 
 
 
145 aa  170  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  55.07 
 
 
159 aa  158  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.85 
 
 
130 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  37.5 
 
 
132 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.81 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.3 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.58 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.81 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.56 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  30.88 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.57 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.61 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.88 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.71 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.6 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  34.13 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.36 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.69 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.74 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.65 
 
 
145 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.4 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.07 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  34.71 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  28.47 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  29.45 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.88 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  32.52 
 
 
256 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.2 
 
 
148 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.57 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.86 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  33.62 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0529  hypothetical protein  27.46 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  29.06 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.13 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  25 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.07 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  22.58 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  29.37 
 
 
245 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4180  hypothetical protein  30.83 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.921596  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  29.84 
 
 
247 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  32.26 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  35.48 
 
 
256 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  20.67 
 
 
155 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  20.67 
 
 
155 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.41 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  26.83 
 
 
264 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  28.57 
 
 
247 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0172  hypothetical protein  28.85 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  31.87 
 
 
236 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  29.25 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  31.82 
 
 
247 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  31.82 
 
 
247 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  28.57 
 
 
245 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>