64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0316 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  100 
 
 
158 aa  323  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  77.92 
 
 
157 aa  245  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  55.63 
 
 
158 aa  170  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.31 
 
 
153 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  35.9 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  46.32 
 
 
148 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  39.86 
 
 
144 aa  101  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  35.57 
 
 
165 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.23 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.23 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.61 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.65 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  35.92 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  39.62 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  36.11 
 
 
139 aa  62.4  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1941  hypothetical protein  36.27 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.653496  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  33.82 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  31.2 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.97 
 
 
138 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0389  hypothetical protein  34.43 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22901  hypothetical protein  34.21 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.74 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  33.58 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.68 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  31.72 
 
 
143 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0172  hypothetical protein  29.6 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  33.65 
 
 
254 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  28.7 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.36 
 
 
130 aa  50.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  37.74 
 
 
250 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.26 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  24.68 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  27.27 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0529  hypothetical protein  31.76 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20141  hypothetical protein  23.38 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0620041  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16881  hypothetical protein  26.27 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  29.85 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 
133 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.03 
 
 
146 aa  47.4  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.86 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  32.65 
 
 
236 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.99 
 
 
132 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  29.01 
 
 
251 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1140  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  23.38 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.811277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  29.52 
 
 
237 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.53 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  31.63 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.78 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.91 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  30.39 
 
 
249 aa  44.3  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  27.62 
 
 
242 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  23.94 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  30.41 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.1 
 
 
128 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.93 
 
 
139 aa  42  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1835  hypothetical protein  31.63 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000551501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1696  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.3 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0603262  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  28.57 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  29.32 
 
 
256 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  27.08 
 
 
134 aa  41.2  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.48 
 
 
142 aa  40.8  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1283  hypothetical protein  32.98 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>