61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0721 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  100 
 
 
157 aa  323  7e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  77.92 
 
 
158 aa  258  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  51.61 
 
 
158 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.1 
 
 
153 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  35.67 
 
 
155 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  47.06 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.54 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.54 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  36.11 
 
 
144 aa  92  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  34.75 
 
 
165 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.37 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.87 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  38.89 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  34.91 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  32.87 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.73 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0389  hypothetical protein  35.48 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0172  hypothetical protein  30.15 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.58 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  28.7 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  30.46 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.84 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  30.6 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.19 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.54 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.78 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.81 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1941  hypothetical protein  32.35 
 
 
184 aa  51.2  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.653496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.09 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16881  hypothetical protein  25.81 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  32.71 
 
 
254 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  30.2 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.66 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  33.96 
 
 
250 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  32.14 
 
 
249 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.74 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  29.82 
 
 
251 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22901  hypothetical protein  33.96 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  28.7 
 
 
237 aa  48.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  28.57 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  29.25 
 
 
242 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.46 
 
 
128 aa  47.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  32.41 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0529  hypothetical protein  30.87 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20141  hypothetical protein  25.16 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0620041  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  30.82 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  35.78 
 
 
236 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  33.94 
 
 
236 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.45 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_12458  COP9 signalosome subunit 5A / CSN subunit 5A (CSN5A) / c-JUN coactivator protein AJH2, putative (AJH2)  32.94 
 
 
218 aa  43.9  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0331122  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  30.93 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  42.86 
 
 
134 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  27.82 
 
 
256 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1140  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  24.52 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.811277  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.93 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1835  hypothetical protein  36 
 
 
99 aa  40.8  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000551501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  27.07 
 
 
256 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  28.12 
 
 
134 aa  40.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>