18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1140 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1140  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  100 
 
 
170 aa  352  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.811277  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20141  hypothetical protein  95.29 
 
 
170 aa  335  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0620041  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16881  hypothetical protein  36.14 
 
 
164 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22901  hypothetical protein  35.67 
 
 
167 aa  101  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0389  hypothetical protein  29.63 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1941  hypothetical protein  38.46 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.653496  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.86 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.86 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.57 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  26.42 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.93 
 
 
153 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  23.38 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  30.28 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  33.33 
 
 
132 aa  44.3  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  20.92 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  25.17 
 
 
143 aa  41.2  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>