71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0466 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  297  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0529  hypothetical protein  81.56 
 
 
143 aa  251  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  76.22 
 
 
143 aa  239  7e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  69.93 
 
 
144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0172  hypothetical protein  69.44 
 
 
144 aa  215  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  69.23 
 
 
143 aa  209  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.01 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.55 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.85 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.53 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  29.75 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  32.21 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.4 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.4 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.36 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  28.87 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  30.71 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.58 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  28.08 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.82 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1289  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.59 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  28.47 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.03 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.76 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.11 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  29.01 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.13 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.6 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  33.59 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.56 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.41 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  28.97 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1696  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.4 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0603262  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0989  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.91 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.93 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.87 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  30.85 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.61 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1100  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.03 
 
 
162 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.952576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0381  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.97 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0397123  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.01 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.9 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.37 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  24.6 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.78 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.13 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  29.37 
 
 
256 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  28.19 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  34.31 
 
 
250 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.83 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16881  hypothetical protein  29.13 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3873  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.7 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1965  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.21 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552168  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1941  hypothetical protein  34.78 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.653496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1009  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.79 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.71 
 
 
145 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.81 
 
 
137 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22901  hypothetical protein  24.82 
 
 
167 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.35 
 
 
136 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  27.69 
 
 
256 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  25.78 
 
 
236 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1140  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  25.17 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.811277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  31.63 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  31.03 
 
 
264 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  28.07 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20141  hypothetical protein  25.17 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0620041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.88 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  34.29 
 
 
134 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>