61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1113 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  100 
 
 
151 aa  300  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.5 
 
 
138 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.73 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.17 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.11 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  28.7 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.08 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.2 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.62 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3049  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  41.03 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.2 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  36.63 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.58 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.83 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.08 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.38 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.32 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.91 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.87 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.06 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.21 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  32.06 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  31.82 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  29.46 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.82 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  30.71 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.98 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.73 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  31.86 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0172  hypothetical protein  31.91 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  30.85 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.35 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.86 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1696  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.51 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0603262  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.11 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  31.53 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.93 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0389  hypothetical protein  30.63 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.71 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  30.85 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  33.33 
 
 
139 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  26.67 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  37.62 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  26.09 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  33.62 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22901  hypothetical protein  31.15 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  31.19 
 
 
242 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.43 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0529  hypothetical protein  28.97 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  30.69 
 
 
237 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.16 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  35.11 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.73 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16881  hypothetical protein  22.58 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  27.73 
 
 
249 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  28.7 
 
 
236 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  24.78 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.61 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>