38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3049 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3049  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  100 
 
 
156 aa  312  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  41.03 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  45.83 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.91 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  31.13 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.93 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  41.77 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.09 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  33.33 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.32 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.27 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  34.34 
 
 
249 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  35.92 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.76 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 
136 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.82 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  24.66 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  29.23 
 
 
129 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
236 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.29 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  27.55 
 
 
236 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
251 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  32.63 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.51 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  27 
 
 
236 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.04 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  26.72 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  28.93 
 
 
256 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  29.75 
 
 
256 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  30.93 
 
 
254 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  31.53 
 
 
237 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.14 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.66 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  29.63 
 
 
242 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  29.9 
 
 
264 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28 
 
 
133 aa  40.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>