69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3930 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  100 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  77.2 
 
 		 254 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  71.6 
 
 		 264 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  58.17 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  57.37 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  46.06 
 
 		 242 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  46.25 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  46.18 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  48.21 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 236 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  40.48 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  37.6 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  41.22 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  39.69 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  32.08 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  39.75 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  37.21 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  34.3 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  33.88 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  32.31 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  34.43 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  34.43 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  34.43 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  34.43 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  32.93 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  32.11 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  32.65 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  33.2 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  31.28 
 
 		 169 aa  112  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  34.98 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  33.49 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  33.49 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  33.49 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  33.49 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  33.49 
 
 		 211 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  32.84 
 
 		 199 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  32.84 
 
 		 199 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  33.98 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  33.97 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  34.45 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  33.97 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  33.49 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  33.01 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  32.14 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  28.22 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.17 
 
 		 130 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.82 
 
 		 136 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  36.84 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.43 
 
 		 139 aa  49.7  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.63 
 
 		 133 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 		 133 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 		 139 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.43 
 
 		 142 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.01 
 
 		 158 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.82 
 
 		 138 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.75 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.82 
 
 		 157 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.67 
 
 		 136 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.96 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  30.53 
 
 		 85 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3049  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  30.59 
 
 		 156 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  30 
 
 		 139 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.72 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.96 
 
 		 138 aa  42.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.93 
 
 		 141 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>