48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3529 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  97.43 
 
 		 272 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  97.06 
 
 		 272 aa  510  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  95.96 
 
 		 272 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  95.96 
 
 		 272 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  83.7 
 
 		 275 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  84.13 
 
 		 275 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  38.85 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  34.15 
 
 		 246 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  34 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  34.66 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  34.26 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  35.61 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  35.16 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  35.16 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  33.06 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  33.76 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  35.27 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  35.29 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  35.45 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  33.47 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  34.77 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  35.16 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  35.42 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  34.85 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  31.37 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  33.47 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  35.94 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  35.94 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  35.94 
 
 		 211 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  35.94 
 
 		 211 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  35.96 
 
 		 245 aa  99  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  44.88 
 
 		 203 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  34.43 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  35.48 
 
 		 211 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  40 
 
 		 169 aa  96.3  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  32.64 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  32.02 
 
 		 236 aa  95.9  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 251 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  40.24 
 
 		 199 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  40.24 
 
 		 199 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  30.57 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  31.95 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  29.44 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  28.8 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  35.9 
 
 		 85 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>