67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3880 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  100 
 
 
250 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  76.11 
 
 
250 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  75 
 
 
250 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  54.44 
 
 
246 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  50.2 
 
 
236 aa  237  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  46.18 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  45.8 
 
 
256 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  41.77 
 
 
242 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  40.73 
 
 
237 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  41.95 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  40.46 
 
 
251 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  41.06 
 
 
254 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  38.78 
 
 
236 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  38.37 
 
 
236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  39.84 
 
 
236 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  39.42 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  39.67 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  43.46 
 
 
240 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  34.38 
 
 
249 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  39.51 
 
 
247 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  38.84 
 
 
247 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  39.09 
 
 
247 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  39.09 
 
 
247 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  37.45 
 
 
247 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  38.02 
 
 
247 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  37.04 
 
 
247 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  37.82 
 
 
245 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  38.66 
 
 
245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 
252 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  32.37 
 
 
250 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  39.2 
 
 
203 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  38.94 
 
 
211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  38.46 
 
 
211 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  38.46 
 
 
211 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  38.46 
 
 
211 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  38.46 
 
 
211 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  40.1 
 
 
199 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  40.1 
 
 
199 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  34.9 
 
 
275 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  32.57 
 
 
169 aa  99  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  35.46 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  34.26 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  34.66 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  35.06 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  34.26 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  34.63 
 
 
275 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  27.57 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  39.53 
 
 
85 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.74 
 
 
158 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.84 
 
 
164 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  27.97 
 
 
155 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.19 
 
 
130 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  40.48 
 
 
137 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  35.53 
 
 
151 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.96 
 
 
157 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.56 
 
 
155 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.56 
 
 
155 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.45 
 
 
148 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  42.11 
 
 
129 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.08 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  33.67 
 
 
143 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  34.88 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  34.88 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  34.31 
 
 
143 aa  43.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.13 
 
 
134 aa  42.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  37.93 
 
 
139 aa  42  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>