62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_A0035 on replicon NC_009726
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  100 
 
 
250 aa  519  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  98.22 
 
 
169 aa  348  6e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  37.39 
 
 
236 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  35.93 
 
 
242 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  38.79 
 
 
240 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  34.5 
 
 
236 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  35.37 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  32.79 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  37.39 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  36.96 
 
 
236 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  32.38 
 
 
256 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  32.08 
 
 
251 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  33.74 
 
 
254 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  35.27 
 
 
247 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  33.78 
 
 
245 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  32.37 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  30.04 
 
 
264 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  33.78 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  33.78 
 
 
243 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  34.38 
 
 
245 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  34.38 
 
 
245 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  33.04 
 
 
247 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  33.04 
 
 
247 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  33.04 
 
 
247 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  31.4 
 
 
250 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  33.48 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  33.93 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  35.12 
 
 
246 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  32.37 
 
 
250 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  31.43 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  35.57 
 
 
211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  35.57 
 
 
211 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  35.57 
 
 
211 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  35.57 
 
 
211 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  35.57 
 
 
211 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  35.68 
 
 
203 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  33.88 
 
 
199 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  33.88 
 
 
199 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  27.66 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  43.08 
 
 
275 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  31.37 
 
 
272 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  31.37 
 
 
272 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
275 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  31.43 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  30.16 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  37.8 
 
 
85 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  29.17 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  26.81 
 
 
173 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  26.04 
 
 
373 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3535  NLP/P60 protein  24.19 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0987599  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  27.27 
 
 
380 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  24.47 
 
 
337 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
175 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  26.04 
 
 
473 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  28.4 
 
 
190 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  28.4 
 
 
190 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  28.4 
 
 
190 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  28.4 
 
 
147 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  28.4 
 
 
147 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  38.64 
 
 
347 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  32.73 
 
 
349 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>