58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1728 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  100 
 
 
129 aa  259  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  52.42 
 
 
128 aa  130  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  43.18 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  39.5 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  41.9 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.14 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.87 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  39 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  38.38 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.03 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  42.65 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.64 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  26.06 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.3 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.71 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  33.33 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.37 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  24.29 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  33.67 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  34.65 
 
 
236 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.19 
 
 
139 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  34.65 
 
 
236 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1835  hypothetical protein  39.36 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000551501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  32.23 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.14 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.17 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.53 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.17 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.46 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  25.76 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  23.08 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.09 
 
 
130 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1011  hypothetical protein  36.51 
 
 
124 aa  47  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.817258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.82 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.13 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.35 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3049  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  29.23 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  32.69 
 
 
236 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.54 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  38.1 
 
 
256 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.13 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  37.62 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
250 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.79 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.83 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  36.47 
 
 
264 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.47 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2246  hypothetical protein  30.36 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.369287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  38.1 
 
 
256 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  30.77 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1283  hypothetical protein  39.19 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0389  hypothetical protein  28.97 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.04 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1812  hypothetical protein  34.18 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3645  hypothetical protein  33.64 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  29.91 
 
 
251 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>